Zagrożenie chorobami tro­pikalnymi na wybrzeżu i w górach jest stosunkowo niewielkie. W regionach nizinnych na wschodzie kraju (Iquitos, Pucallpa) występuje umiarkowane zagrożenie malarią i dengą. Szcze­pienia ochronne w zasadzie nie są wymagane. Służba zdrowia powiadamia o konieczności takich szczepień, jeśli pojawiają się symptomy epidemii, a podróżujący udają się do obszarów zagrożonych. Szczepień przeciw żółtej febrze można dokonać na miejscu (koszt ok. 10 USD).

Udających się z Peru do Bra­zylii obowiązuje szczepienie przeciw żółtej febrze (można się zaszczepić na lotnisku w Limie). Szczepienie przeciw cholerze nie jest wymagane ze względu na małą skuteczność. Zdarzają się przypadki choroby wysokościowej (soroche), która objawia się bólami głowy, brzucha i torsjami.

Opieka medyczna jest ogólnodostępna w większych ośrodkach miejskich. Koszt standardowej wizyty lekarskiej wynosi 50 USD, EKG – ok. 20 USD, badań analitycznych – 70 USD, USG – ok. 60 USD. Doba w szpitalu lub klinice kosztuje od 30 do 100 USD.